SeqKat:检测Kataegis

Kataegis是当一个区域富含体细胞SNV时发生的局部超突变。Kataegis可能由AID/APOBEC蛋白质家族催化的多个胞嘧啶脱氨酶引起。该软件包包含从BED格式的SNV中检测kataegis的功能。该软件包报告了每一个kataegic事件的两个分数，一个超突变分数和一个APOBEC介导的Kataegical分数。Yousif，F.等人。；局部和全局体细胞过度突变的起源和后果；生物科技2018<数字对象标识代码：10.1101/287839>.

版本：	0.0.8
取决于：	R（≥2.15.1），foreach公司,do并行
进口：	卢比(≥ 0.11.0)
链接到：	卢比
建议：	测试那个,美国国防部,rmarkdown公司,针织物
出版：	2020-03-11
内政部：	10.32614/CRAN.包装。SeqKat公司
作者：	福阿德·尤西夫（Fouad Yousif）、林喜辉（Xihui Lin）、范凡（Fan Fan）、克里斯托弗·拉兰辛格（Christopher Lalansingh）、约翰·麦克唐纳（John Macdonald）
维护人员：	保罗·布特罗斯（Paul C.Boutros）<pboutros at mednet.ucla.edu>
许可证：	GPL-2型
需要编译：	对
材料：	新闻
CRAN检查：	SeqKat结果

文档：

参考手册：	SeqKat.pdf系列
渐晕图：	SeqKat公司

下载内容：

包源：	序号Kat_0.0.8.tar.gz
Windows二进制文件：	r-devel公司：SeqKat_0.0.8.zip序列，r版本：SeqKat_0.0.8.zip序列，r-oldrel：SeqKat_0.0.8.zip序列
macOS二进制文件：	r释放（arm64）：序号Kat_0.0.8.tgz，r-oldrel（arm64）：序号Kat_0.0.8.tgz，r-版本（x86_64）：SeqKat_0.0.8.tgz序列，r-oldrel（x86_64）：序号Kat_0.0.8.tgz
旧来源：	SeqKat存档

链接：

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