SNPfiltR：交互式筛选SNP数据集

设计用于交互式和可重复地可视化和过滤SNP（单核苷酸多态性）数据集。基于R的SNP实现基因型过滤器有助于交互式迭代SNP过滤管道，可以记录通过Rmarkdown复制。”SNPfiltR包含可视化功能SNP数据集的各种质量和缺失数据指标，然后进行筛选基于用户指定的截止值的数据集。所有函数都将“vcfR”对象作为输入，这很容易通过使用将标准vcf（变量调用格式）文件读入R生成R包“vcfR”（Knaus和Grünwald）(<doi:10.1111/1755-0998.12549>). 每个“SNPfiltR”函数都可以返回一个新筛选的vcfR对象，然后可以使用“vcfR”包以标准vcf格式写入本地目录，用于下游种群遗传和系统发育分析。

版本：	1.0.1
取决于：	R（≥2.10）
进口：	录像机,ggplot2,Rtsne公司,集群,阿德根特,额外网格,ggridges公司，统计，图形，实用程序
建议：	rmarkdown公司,针织物
出版：	2023-03-17
内政部：	10.32614/CRAN.包装。SNP过滤器R
作者：	德文·德拉德[aut，cre]
维护人员：	德文·德拉德（Devon DeRaad）<devonderad at gmail.com>
许可证：	麻省理工学院+文件许可证
需要编译：	不
材料：	自述文件
在视图中：	Missing数据
CRAN检查：	SNPfiltR结果

文档：

参考手册：	SNPfiltR.pdf文件
守夜人：	可复制的火成岩

下载内容：

包源：	SNP过滤器R_1.0.1.tar.gz
Windows二进制文件：	r-devel公司：SNPfiltR_1.0.1.zip文件，r-释放：SNPfiltR_1.0.1.zip文件，r-旧版本：SNPfiltR_1.0.1.zip文件
macOS二进制文件：	r释放（arm64）：SNP过滤器R_1.0.1.tgz，r-oldrel（arm64）：SNP过滤器R_1.0.1.tgz，r-release（x86_64）：SNP过滤器R_1.0.1.tgz，r-oldrel（x86_64）：SNP过滤器R_1.0.1.tgz
旧来源：	SNPfiltR存档

链接：

请使用规范形式https://CRAN.R-project.org/package=SNPfiltR链接到此页面。