SNPassoc:基于SNPs的全基因组关联研究

在基因组中执行大多数常见分析的功能实施了关联研究。这些分析包括描述性分析缺失值的统计和探索性分析,计算哈代-温伯格均衡,基于广义关联分析线性模型(数量性状或二元性状)和分析多个SNP(单倍型和上位性分析)。排列测试以及相关测试(总和统计和截断乘积)已实施。最大统计和遗传风险等位基因精确评分分布也可以估计。方法如下Gonzalez JR等人,2007年<doi:10.1093/bioinformatics/btm025>.

版本: 2.1-0
取决于: R(≥4.0.0)
进口: 单倍统计,mvtnorm公司,平行,生存,三年,胶合板,ggplot2,毒物
建议: 测试那个,针织物,rmarkdown公司,生物电阻,变量注释,基因组范围,I范围,S4载体,组织Hs.eg.db,TxDb(发送日期)。哈皮恩斯。UCSC.hg19.known基因,仿生风格
出版: 2022-12-14
内政部: 10.32614/CRAN.包装。SNPassoc公司
作者: 维克托·莫雷诺,胡安·冈萨雷斯ORCID标识[自动],多洛斯·佩莱格里ORCID标识[aut,cre]
维护人员: Dolors Pelegri<Dolors.Pelegri at isglobal.org>
许可证: GPL-2型|GPL-3公司[扩展自:GPL(≥2)]
网址: https://github.com/isglobal-brge/SNPassoc
需要编译:
材料: 自述
在视图中: Missing数据
CRAN检查: SNPassoc结果

文档:

参考手册: SNPassoc.pdf文件
渐晕图: SNPassoc:执行全基因组关联研究的R包

下载内容:

包源: SNPassoc_2.1-0.tar.gz号
Windows二进制文件: r-devel公司:SNPassoc_2.1-0.zip码,r版本:SNPassoc_2.1-0.zip码,r-oldrel:SNPassoc_2.1-0.zip码
macOS二进制文件: r释放(arm64):SNPassoc_2.1-0.tgz,r-oldrel(arm64):SNPassoc_2.1-0.tgz,r-版本(x86_64):SNPassoc_2.1-0.tgz,r-oldrel(x86_64):SNPassoc_2.1-0.tgz
旧来源: SNPassoc存档

反向依赖关系:

反向进口: 省道R.base

链接:

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