Rgff:R GFF文件实用程序

gff文件的R实用程序,可以是通用特征格式(GFF3)或基因转移格式(GTF)格式的文件。该软件包包括以下功能:生成汇总统计信息、检查一致性和排序错误、从GTF格式转换为GFF3格式、文件排序、可视化和绘制要素层次,以及将用户定义的要素子集导出为SAF格式。该工具由CNB-CSIC的BioinfoGP核心设施开发。

版本: 0.1.6
进口: 用r(≥ 2.4.3),拉朗(≥ 0.4.12),斯特林吉(≥ 1.7.6),数据树(≥ 1.0.0),第三年(≥ 1.1.4),易怒的(≥ 3.1.6),数字播放器(≥ 1.0.7),RJSONIO公司(≥ 1.3-1.6),马格里特(≥ 2.0.1)
建议: 图表R(≥ 1.0.6.1),图表Rsvg(≥ 0.1),rsvg公司(≥2.2.0),rmarkdown公司(≥ 2.11),针织物(≥ 1.36),基因组范围(≥1.46.1),rtracklayer公司(≥ 1.54.0),S4载体(≥ 0.32.3)
出版: 2022-09-30
内政部: 10.32614/CRAN.包装。俄罗斯联邦储备基金
作者: 胡安·安东尼奥·加西亚-马汀ORCID标识[cre,aut],胡安·卡洛斯·奥利维罗斯ORCID标识[aut,ctb],拉斐尔·托雷斯-佩雷斯ORCID标识[aut,ctb]
维护人员: 胡安·安东尼奥·加西亚-马汀(Juan Antonio Garcia-Martin)<ja.Garcia at cnb.csic.es>
许可证: GPL(≥3)
需要编译:
材料: 新闻
CRAN检查: Rgff结果

文档:

参考手册: Rgff.pdf格式
渐晕图: 使用Rgff

下载内容:

包源: Rgf_0.1.6.tar.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:Rgf_0.1.6.zip(压缩包),r版本:Rgf_0.1.6.zip(压缩包),r-oldrel:Rgf_0.1.6.zip(压缩包)
macOS二进制文件: r释放(arm64):Rgf_0.1.6.tgz,r-oldrel(arm64):Rgf_0.1.6.tgz,r-release(x86_64):Rgf_0.1.6.tgz,r-oldrel(x86_64):Rgf_0.1.6.tgz
旧来源: Rgff存档

链接:

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