RZooRoH:将个体自合子划分为多个纯合-by-Descent类

鉴定与纯合性(ROH)相关的纯合性(HBD)片段的功能估计个体的纯合度(或近交系数)。HBD片段和纯合子被分配到多个HBD类别基于模型的方法依赖于指数分布的混合。指数分布的速率是明显的并定义HBD段的预期长度。因此,这些HBD等级与片段(较长的片段和较小的近期纯合子/近期共同祖先比率)。这些函数允许估计模型参数(指数分布率、混合比例),用于估计全局和局部纯合度概率,并使用维特比译码识别HBD片段。该方法在Druet和Gautier(2017)中有详细描述<doi:10.1111/mec.14324>.

版本: 0.3.2.1
取决于: R(≥3.2.0),方法
进口: foreach公司,do并行,平行,数据表,R彩色啤酒,迭代器
建议: 针织物,rmarkdown公司,测试那个
出版: 2023-10-27
内政部: 10.32614/CRAN.包装。RZoo道路
作者: Tom Druet、Naveen Kumar Kadri、Amandine Bertrand和Mathieu Gautier
维护人员: 汤姆·德鲁特(Tom Druet)
许可证: GPL-3公司
需要编译:
引用: RZooRoH引用信息
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