RQdeltaCT:使用Delta Ct对基因表达进行相对量化方法
实时PCR(聚合酶链反应)实验中获得的基因表达水平相对定量的常用方法是delta Ct方法,包括最初由Kenneth J.Livak和Thomas D.Schmittgen(2001)提出的2^-dCt和2^-ddCt方法<doi:10.1006/meth.2001.1262>. 其主要思想是使用内源性控制基因使基因表达值正常化,使用2^-(值)转换以线性形式表示基因表达水平,并计算各组样品(或单个样品的技术复制品)之间的基因表达水平差异。“RQdeltaCT”包提供的功能涵盖了两种方法,用于比较独立样本组或成对样本组,以及导入表达式数据集,对数据进行多步骤质量控制,实现大量数据可视化,通过额外有用的分析(相关性分析、接收器操作特性分析、逻辑回归)丰富标准工作流程,并以表格和图像格式方便地导出获得的结果。该软件包设计为对R编程中的非专业人士友好。
版本: |
1.3.0 |
取决于: |
R(≥2.10) |
进口: |
潮韵诗,数字播放器,ggplot2,马格里特,第三年,潮汐选择,硬币,ctrlGene基因,ggsignif公司,Hmisc公司,校正图,ggpmisc公司,pROC公司,奇数比率,统计数据,图形,grDevices,utils,情势图,GGally公司 |
建议: |
针织物,rmarkdown公司,测试那个(≥ 3.0.0) |
出版: |
2024-04-17 |
内政部: |
10.32614/CRAN.包装。RQ增量CT |
作者: |
丹尼尔·扎勒夫斯基[aut,cre] |
维护人员: |
丹尼尔·扎勒夫斯基(Daniel Zalewski)<Daniel.piotr.Zalewski at gmail.com> |
许可证: |
GPL-3公司 |
网址: |
<https://github.com/Donadelnal/RQdeltaCT网址> |
需要编译: |
不 |
材料: |
自述 |
CRAN检查: |
RQdeltaCT结果 |
文档:
下载内容:
链接:
请使用规范形式https://CRAN.R-project.org/package=RQdeltaCT链接到此页面。