RQdeltaCT:使用Delta Ct对基因表达进行相对量化方法

实时PCR(聚合酶链反应)实验中获得的基因表达水平相对定量的常用方法是delta Ct方法,包括最初由Kenneth J.Livak和Thomas D.Schmittgen(2001)提出的2^-dCt和2^-ddCt方法<doi:10.1006/meth.2001.1262>. 其主要思想是使用内源性控制基因使基因表达值正常化,使用2^-(值)转换以线性形式表示基因表达水平,并计算各组样品(或单个样品的技术复制品)之间的基因表达水平差异。“RQdeltaCT”包提供的功能涵盖了两种方法,用于比较独立样本组或成对样本组,以及导入表达式数据集,对数据进行多步骤质量控制,实现大量数据可视化,通过额外有用的分析(相关性分析、接收器操作特性分析、逻辑回归)丰富标准工作流程,并以表格和图像格式方便地导出获得的结果。该软件包设计为对R编程中的非专业人士友好。

版本: 1.3.0
取决于: R(≥2.10)
进口: 潮韵诗,数字播放器,ggplot2,马格里特,第三年,潮汐选择,硬币,ctrlGene基因,ggsignif公司,Hmisc公司,校正图,ggpmisc公司,pROC公司,奇数比率,统计数据,图形,grDevices,utils,情势图,GGally公司
建议: 针织物,rmarkdown公司,测试那个(≥ 3.0.0)
出版: 2024-04-17
内政部: 10.32614/CRAN.包装。RQ增量CT
作者: 丹尼尔·扎勒夫斯基ORCID标识[aut,cre]
维护人员: 丹尼尔·扎勒夫斯基(Daniel Zalewski)<Daniel.piotr.Zalewski at gmail.com>
许可证: GPL-3公司
网址: <https://github.com/Donadelnal/RQdeltaCT网址>
需要编译:
材料: 自述
CRAN检查: RQdeltaCT结果

文档:

参考手册: RQ增量CT.pdf
守夜人: RQdeltaCT-使用Delta Ct方法对基因表达进行相对量化

下载内容:

包源: RQ增量CT_1.3.0.tar.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:RQdeltaCT_1.3.0.zip文件,r版本:RQdeltaCT_1.3.0.zip文件,r-oldrel:RQdeltaCT_1.3.0.zip文件
macOS二进制文件: r释放(arm64):RQ增量CT_1.3.0.tgz,r-oldrel(arm64):RQ增量CT_1.3.0.tgz,r-release(x86_64):RQ增量CT_1.3.0.tgz,r-oldrel(x86_64):RQ增量CT_1.3.0.tgz
旧来源: RQdeltaCT存档

链接:

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