提供了一些有用的包装器函数,可以简化在R中读取、分析和可视化可变调用格式(vcf)文件。此包旨在促进显式管道优化斯塔克斯(Rochette等人,2019年)(<doi:10.1111/mec.15253>)从头组装(无参考基因组)和变异过程中的参数限制酶相关DNA序列(RADseq)数据的调用。这个此处实施的管道基于2017年的论文“迷失在参数空间”(巴黎等,2017)(<doi:10.1111/2041-210X.12775>)其中为优化参数制定明确的建议“m”、“m”和“n”,在装配轨迹的过程中。
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