PTXQC:生成MaxQuant和mzTab结果的质量报告

生成蛋白质组学(PTX)质量控制(QC)报告,用于使用MaxQuant软件套件(来自.txt文件)或mzTab文件(最好来自OpenMS“QualityControl”工具)。报告可定制(目标阈值、子设置),并以HTML或PDF格式提供。发表于J.Proteome Res.,蛋白质组学质量控制:MaxQuant结果的质量控制软件(2015)<doi:10.1021/acs.jproteome.5b00780>.

版本: 1.1.1
取决于: R(≥3.3.0)
进口: 数据表,ggplot2(≥ 2.2),ggdendro公司,网格,额外网格,gr设备,gtable表,html表格,针织物(≥ 1.10),马格里特、方法、,普利尔,R6级,R6P型,R彩色啤酒,重塑2,rmarkdown公司,rmzqc公司(≥ 0.5.0),顺序,统计,实用程序,UpSetR(升级程序),xml语言2,山药
建议: 测试那个
出版: 2024-03-11
内政部: 10.32614/CRAN.包装。PTXQC公司
作者: 克里斯·比洛[aut,cre],朱利安·施马赫滕贝格,斯温贾·瓦格纳,帕特里夏·谢尔(Patricia Scheil),汤姆·沃奇切克,吉多·马斯特罗布奥尼[dtc,rev]
维护人员: Chris Bielow在bsc.fu-berlin.de>
错误报告: https://github.com/cbielow/PTXQC/issues网站
许可证: BSD_3_条款+文件许可证
网址: https://github.com/cbielow/PTXQC
需要编译:
系统要求: 潘多克(http://pandoc.org)用于构建渐晕并将报告输出为HTML
引用: PTXQC引文信息
材料: 自述 新闻
在视图中: 组学
CRAN检查: PTXQC结果

文档:

参考手册: PTXQC.pdf
渐晕图: PTXQC基本R使用指南
自定义PTXQC报告
PTXQC拖放使用指南
PTXQC常见问题
PTXQC的输入/输出数据
指标列表

下载内容:

包源: PTXQC_1.1.1.tar.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:PTXQC_1.1.1.zip,r版本:PTXQC_1.1.1.zip文件,r-oldrel:PTXQC_1.1.1.zip
macOS二进制文件: r释放(arm64):PTXQC_1.1.1.tgz,r-oldrel(arm64):PTXQC_1.1.1.tgz,r-release(x86_64):PTXQC_1.1.1.tgz,r-oldrel(x86_64):PTXQC_1.1.1.tgz
旧来源: PTXQC档案

反向依赖关系:

反向进口: RCorA客户端

链接:

请使用规范形式https://CRAN.R-project.org/package=PTXQC链接到此页面。