MetaIntegrator:基因表达数据的Meta分析

基因表达数据的荟萃分析管道。我们有组装了几个分析和绘图函数对基因表达数据(meta-分析)。方法描述见:<http://biorxiv.org/content/early/2016/08/25/071514>.

版本: 2.1.3
取决于: R(≥3.6)
进口: 生物技术经理,rmeta公司,multtest公司,ggplot2,平行,Rmisc公司,gplots(gplots),博科生物,RMySQL,数据库接口,字符串,预处理核心,地理查询,地理数据库,RSQ网站,数据表,ggpubr公司,收益率,动物园,普拉克马,椰子,度量标准,曼哈顿的,DT公司,情势图,普利尔,靴子,数字播放器,重塑2,rmarkdown公司,注释Dbi,HGNC助手,马格里特,阅读器,巧妙地,httpuv公司
建议: 仿生风格,针织者,RUnit(运行单位),生物遗传学,snplist公司,魔法
出版: 2020年2月26日
DOI(操作界面): 10.32614/CRAN.包装。元积分器
作者: 温斯顿·A·海恩斯(Winston A.Haynes)、弗朗西斯科·瓦拉尼亚(Francesco Vallania)、奥雷利·托姆萨克(Aurelie Tomczak)、蒂莫西·斯威尼(Timothy Sweeney)、,Erika Bongen、Aditya M.Rao、Purvesh Khatri
维护人员: Aditya M.Rao<斯坦福大学的adityamr>
许可证: LGPL-2型|LGPL-2.1型|LGPL-3型[扩展自:LGPL]
网址: http://biorxiv.org/content/early/2016/08/25/071514
需要编译:
引用: MetaIntegrator引用信息
材料: 自述文件 新闻
在视图中: 元分析,组学
CRAN检查: MetaIntegrator结果

文档:

参考手册: 元积分器.pdf
守夜人: 基因表达数据分析
MetaIntegrator关于GEO数据的真实示例

下载内容:

包源: 元积分器_2.1.3.tar.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:元积分器_2.1.3.zip,r版本:MetaIntegrator_2.1.3.zip,r-oldrel:元积分器_2.1.3.zip
macOS二进制文件: r释放(arm64):元积分器_2.1.3.tgz,r-oldrel(arm64):元积分器_2.1.3.tgz,r-release(x86_64):元积分器_2.1.3.tgz,r-oldrel(x86_64):元积分器_2.1.3.tgz
旧来源: MetaIntegrator存档

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