使用MCMC对多元计数数据进行泊松对数正态广义线性混合模型分析,旨在推断单个变量相对比例的变化。该软件包最初设计用于微生物群落的基于序列的分析(“元条形码”,变量=操作分类单元,OTU),但可以用于其他类型的多元计数,例如生态应用(变量=物种)。使用“ggplot2”函数对结果进行汇总和绘制。包括删除样本和变量异常值的函数,并将计数重新格式化为标准化的日志转换值,以进行相关性和主成分/坐标分析。演练和示例:http://www.bio.utexas.edu/research/matz_lab/matzlab/Methods_files/walkthrough示例_mcmcOTU_R.txt.
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