MBMethPred:髓母细胞瘤亚群预测

利用机器学习模型(Random Forest、Naive Bayes、K-Nearest Neighbor、Support Vector Machines、Extreme Gradient Boosting和Linear Discriminant Analysis)和深度人工神经网络模型的组合,“MBMethPred”可以预测髓母细胞瘤亚群,包括无翼(WNT)、声波刺猬(SHH)、第3组、,和第4组的DNA甲基化β值。参见Sharif Rahmani E、Lawarde A、Lingasamy P、Moreno SV、Salumets A和Modhukur V(2023),MBMethPred:使用数据集成和基于人工智能的方法准确分类儿童髓母细胞瘤亚群的计算框架。前面。遗传学。14:1233657. <doi:10.3389/fgene.2023.1233657>了解更多详细信息。

版本: 0.1.4.2
取决于: R(≥3.5.0)
进口: 字符串,ggplot2,平行,caTools(计算机辅助工具),插入符号,珊瑚礁,MASS(质量),Rtsne公司,SNF工具,,数字播放器,e1071号,pROC公司,随机森林,读数器,重塑2,网状的,rgl公司,张量流,xgboost公司
建议: 针织物,rmarkdown公司,测试那个,实用程序,统计信息,规模
出版: 2023-09-18
内政部: 10.32614/CRAN.包装。MBMethPred公司
作者: 埃德里斯·谢里夫·拉赫马尼ORCID标识[aut、ctb、,cre],安基塔·苏尼尔·拉瓦德ORCID标识[aut,ctb],维贾亚奇特拉·莫杜库尔ORCID标识[aut,ctb]
维护人员: Edris Sharif Rahmani<Rahmani.biotech at gmail.com>
错误报告: https://github.com/sharifrahmanie/MBMethPred/issues网站
许可证: GPL-2型|GPL-3公司[扩展自:GPL]
网址: https://github.com/sharifrahmanie/MBMethPred
需要编译:
CRAN检查: MBMethPred结果

文档:

参考手册: MBMethPred.pdf公司
渐晕图: MBMethPred简介

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旧来源: MBMethPred存档

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