JBrowseR:JBrowse 2基因组浏览器的R接口

为JBrowse 2基因组浏览器提供一个R接口。支持在Shiny应用程序或R Markdown中嵌入JB2基因组浏览器文档。也可以从交互式R控制台启动浏览器。浏览器可以加载多种常见的基因组数据类型,并且可以与自定义主题一起使用。

版本: 0.10.2
进口: html工具,html小部件,反应器,字符串,马格里特,阅读器,jsonlite公司,httpuv公司,哑剧演员,克莱,身份证,数字播放器
建议: 测试那个(≥ 3.0.0),针织者,rmarkdown公司
出版: 2023-12-20
内政部: 10.32614/CRAN.包装。J浏览器R
作者: 埃利奥特·赫什伯格ORCID标识[aut],科林·迪什ORCID标识[自动,cre],JBrowse 2团队
维护人员: 科林·迪什(Colin Diesh)<Colin.Diesh at gmail.com>
许可证: Apache许可证(≥2)
网址: https://gmod.github.io/JBrowseR/ https://github.com/GMOD/JBrowseR
需要编译:
材料: 自述文件 新闻
在视图中: 组学
CRAN检查: JBrowserR结果

文档:

参考手册: J浏览R.pdf
守夜人: JBrowseR简介
创建URL
自定义浏览器教程
高级JSON教程

下载内容:

包源: J浏览器R_0.10.2.tar.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:JBrowseR_0.10.2.zip文件,r版本:JBrowseR_0.10.2.zip文件,r-oldrel:JBrowseR_0.10.2.zip文件
macOS二进制文件: r释放(arm64):J浏览器R_0.10.2.tgz,r-oldrel(arm64):J浏览器R_0.10.2.tgz,r-release(x86_64):J浏览器R_0.10.2.tgz,r-oldrel(x86_64):J浏览器R_0.10.2.tgz
旧来源: JBrowserR存档

反向依赖关系:

反向进口: 视图多边形

链接:

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