化石模拟人

用于在系统发育树上模拟化石数据的R包保存和取样的机械模型

使用该软件包可以在R中安装最新版本开发工具：

库（devtools）安装github（“fossilsim/fossilsim”）

快速入门

使用模拟数据化石模拟人可以像以下代码段。

#使用猿模拟树提示=8t=ape:：rtree（提示）#使用fossilsim模拟化石比率=2f=模拟化石泊松（比率，t）#绘制完整输出绘图（f，t）#绘制重建的输出绘图（f，t，重建=真）
#使用fossilsim模拟分类法β=0.5#对称物种形成概率lambda.a=0.1#再生率s=模拟分类法（t，beta，lambda.a）#绘制输出plot（s，t，legend.position=“bottomright”）

包装小品

以下想定案例可通过CRAN获得，并提供详细信息示例：

对于更多信息和示例请参阅软件包文档

贡献者

乔尔·巴里多·索塔尼
沃克·佩特·约瑟夫·奥莱利
雷切尔·沃诺克

引用

Joölle Barido-Sottani等人，2019年。方法的演变&生态学.FossilSim公司：机械模拟化石产出数据的R包保存和恢复模型