DGEobj:差异基因表达(DGE)分析结果数据对象
提供一个灵活的容器来管理和注释差异基因表达式(DGE)分析结果(Smythe等人(2015))<doi:10.1093/nar/gkv007>). DGEobj具有行(基因)、列(样本)、分析(矩阵n行)的数据槽通过m-samples维度)和元数据(没有键控到行、列或分析)。存放、查询和检索数据子集的一组辅助功能已提供工作流。属性用于捕获元数据,例如物种和基因模型,包括再现性信息参与方可以访问DGEobj历史记录,以查看每个数据对象是如何创建的,或者被改进的。由于DGEobj是可定制和可扩展的,因此它不受限制RNA-seq分析类型的工作流程–它几乎可以容纳任何数据分析工作流,从按样本(列)的分析矩阵(行)开始。
版本: |
1.1.2 |
取决于: |
R(≥3.5.0) |
进口: |
断言,马格里特,字符串,实用程序 |
建议: |
生物反应器,冲突的,数字播放器,边缘R,基因组范围,胶,针织物,rmarkdown公司,测试那个 |
出版: |
2022-05-16 |
内政部: |
10.32614/CRAN.包装。DG对象 |
作者: |
约翰·汤普森,康妮·布雷特,Isaac Neuhaus【aut】,瑞安·汤普森 |
维护人员: |
康妮·布雷特(Connie Brett)<aggregate-genius.com> |
许可证: |
GPL-3公司 |
需要编译: |
不 |
语言: |
英语-美国 |
材料: |
自述 新闻 |
在视图中: |
组学 |
CRAN检查: |
DGEobj结果 |
文档:
下载内容:
反向依赖关系:
链接:
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