布拉科德。R: BRACoD:成分数据的贝叶斯回归分析
该方法的目的是在16S或其他成分数据中确定细菌与环境变量之间的关联。环境变量是针对每个微生物组样本测量的任何变量,例如,与数据中每个样本配对的丁酸盐测量值。微生物组数据是成分数据,这意味着每个样品的总丰度总和为1,这会导致严重的统计失真。该方法采用贝叶斯方法来纠正这些统计失真,其中总丰度被视为未知变量。这个包使用网状结构运行python实现。
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