BClustLonG:一个纵向聚类的Dirichlet过程混合模型基因表达数据
已经提出了许多聚类方法,但它们大多不能用于纵向基因表达数据。“BClustLonG”是一个软件包,允许我们对纵向基因表达数据。它采用线性混合效应框架对基因随时间的轨迹进行建模,而聚类是联合的根据从所有基因获得的回归系数进行。为了解释基因之间的相关性并缓解高维挑战,采用因子分析模型回归系数。Dirichlet过程先验分布用于回归系数的平均值以诱导聚类。此包允许用户指定用于集群的变量(截距或斜率或两者)以及是否需要因子分析模型。有关该方法的更多详细信息,请参阅Jiehuan Sun等人(2017)<数字对象标识代码:10.1002/sim.7374>.
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