繁殖程序“AlphaSim”软件的继承者模拟[Faux等人(2016)<doi:10.3835/植物基因组2016.02.0013>]. 用于繁殖程序到DNA水平的随机模拟每个人的顺序。Contained是一系列用于为育种计划中的常见任务建模,例如选择和杂交。这些功能允许构建高度复杂的设备和在R软件环境中通过脚本编写动物繁殖程序。这样的模拟可以用于评估整个育种计划的性能和对育种计划设计进行研究,例如基因组选择。包括“马尔科夫联合模拟器”(“MaCS”)用于根据群体快速模拟双等位基因序列人口统计学史[Chen等人(2009)<doi:10.1101/gr.083634.108>].
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