该平台的最新版本-23.12-现可在平台.opentargets.org.
关键点
除了定期更新数据外:
关键统计信息
公制 |
计数 |
目标 |
62,733 |
疾病 |
25,246 |
药物 |
17,095 |
证据 |
16,710,896 |
协会 |
7,994,180 |
其他指标可用关于开放目标社区.
目标优先级
本次发布的一个主要新功能是靶标优先化视图,该视图在评估靶标对药物发现计划的适用性时,提供了对感兴趣的靶标特异性的评估。
在搜索与疾病相关的目标时,可以从目标-疾病关联页面访问新页面,并单击目标优先级因子选项卡。目标的结构与我们当前的关联视图类似,它是根据其感兴趣疾病的总体关联分数排序的,用户可以在视图中直接浏览一系列目标注释。
此视图中显示的数据也可在我们的目标配置文件页面中找到。这里介绍的是一个以药物发现为重点的额外分析层。我们设计了一个红绿灯评分系统,为用户提供目标属性的概览。在这个色标上,绿色表示潜在的积极属性,而红色表示可能分别导致目标优先级或降级的潜在消极属性。
目标地产已被汇总为四类——优先性、可牵引性、可操作性、安全性——并作为开放目标项目的一部分进行单独评分。在平台文档中了解有关评分的更多信息.
这些评估将作为项目进展的一部分进行,因此欢迎对此观点的任何反馈。
此版本为平台引入了一个新的数据源:药物遗传学小部件将包含人类基因变异对药物反应影响的数据。您可以在目标和药物简介页面上找到这些数据。
新的小部件显示了药物、疾病/表型和基因之间的关系,包括影响药物代谢、疗效和不良反应的遗传变异的详细信息。
该数据源的第一个版本集成了药物基因组学知识资源PharmGKB的数据。除其他活动外,PharmGKB团队注释了遗传变异和基因药物相关性,并总结了重要的药物基因组基因、遗传变异与药物之间的关联以及药物途径。
这提供了有关影响患者对药物反应的遗传变异的信息,使治疗假设的制定更加精细,同时考虑到特定的遗传背景如何影响治疗结果。
该平台仅展示高可信度记录(PharmGKB分类系统中的1A、1B、2A和2B)。在未来的版本中,我们将重点简化作为星形等位基因报告的变异体的整合,确保我们的药物遗传学数据与该领域临床医生和研究人员使用的通用符号一致。
协会的改进——动态
由于我们社区的反馈,我们一直在改进我们在上一版本(23.09)中引入的关联视图。
Associations-on-fly现在允许用户以json或tsv格式导出关联表和目标优先级表。可以根据用户的偏好自定义导出参数。
我们还添加了锁定感兴趣行的功能。固定行会创建一个自定义的、可共享的url,以便于引用。
这是今年的最后一次发布,但明年我们会为您准备更多!像往常一样,请分享关于开放目标社区.