什么是MADE4? MADE4是用统计语言编写的包R(右).制造4支持微阵列和其他基因组数据集的多元分析。它可以阅读生物导体微阵列数据格式并发送这些到多元统计分析包ADE4型. 它有几个增强的图形功能,有助于微阵列多元分析结果的可视化数据。
MADE4中有哪些功能? MADE4中的函数列表及其示例可用,请参见帮助页面包中描述了如何应用MADE4函数的教程小插曲. MADE4的当前版本是什么?
当前版本:1.2.0 发布日期:2005年9月21日
MADE4的最新版本可从生物导体。
如何安装MADE4? MADE4在Bioconductor中可用。从生物导体下载.
可以使用R命令安装MADE4:install.packages(“made4”,repos=“http://www.bioconductor.org") 警觉地,从生物导体下载。并使用以下命令手动安装: Windows用户可以下载.zip文件,然后使用菜单进行安装。为此,请单击 包->从本地zip文件安装包 或者,您希望从源代码(Linux、Mac或Windows)安装,请下载.tar.gz版本。在命令提示符下键入 R CMD安装made4_xxx.tar.gz 其中xxx是MADE4的版本号。
我如何引用MADE4? 请引用:Culhane AC、Thioulouse J、Perriere G、Higgins DG。(2005)MADE4:基因表达数据多元分析的R包。生物信息学.21(11):2789-90.预印本
在哪里可以下载完整的示例数据集?在made4中,示例数据集(NCI60,Khan)被缩减。这是为了使包裹保持较小。因此,Khan数据集仅包含该数据集中2308个基因中的306个。NCI60 Ross等人和Staunton等人的数据仅包含144行(基因)。完整的数据集可以从以下位置下载http://bioinf.ucd.ie/people/edin/R/full_datasets/
我应该向谁报告错误? 如果可能,请使用R命令traceback获取错误信息和将此信息和错误详细信息发送至:
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