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作者:S.Janssen
RNAsifter是基于抽象形状方法的rfam数据库的非严格过滤器。
它利用特定于家族的二级结构,即计算查询序列的形状并进行比较
将其转换为预先计算的形状-index。
确切的匹配提供了——希望只有少数——糖果家庭
这种质问可能会失败。
候选家庭的成员资格通过cmsearch程序进行检查,
之后。
请RNAsifter用户引用:
詹森、斯特凡和里德、延斯和吉格里奇、罗伯特
基于形状的索引用于更快地搜索RNA家族数据库
,BMC生物信息学,2009
建造于2015年3月4日(1:c15c2464276e)
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