程序mmfind评估多个FASTA格式的对齐不匹配。如果提供了带有分数的文件，则会考虑质量分数。有几个过滤选项可用。检测到的不匹配包括测试了三种有意义的品质。
mmfind是用Python编写的命令行工具。它使用Python 2.6、2.7和3.1进行了测试。
