作者:T.Fiedler
欢迎来到jPREditor项目。该计划主要针对顺式调节元件的预测。短序列片段,即转录已知因子结合位点在这些元素中富集和聚集。这些结合位点被表示为基序,为了进行预测,必须知道它们。使用这些图案,可以在序列上搜索它们,并根据它们进行加权应用积极或消极的训练集(分别是模型或背景)为一个序列打分。请参阅手册,了解如何为预测调控因素。在1.22版中,有两个新应用程序纳入jPREdictor:通过基序进化和基序发现基序群集。这两个任务只能通过命令行启动。请参考手册再次获得关于它们如何工作以及如何调用的简要描述。
自24日起。2008年4月,jPREdictor的1.23版本可用。一些更改是通过进化和模体聚类发现模体终于正式了。有关以下方面的进一步解释,请参阅历史记录部分更改和改进。
2015年3月4日建成(1:b69c50d26b72)
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