琥珀色是一套生物分子模拟程序。它开始于20世纪70年代末由积极的发展团体维持；查看我们的历史记录页面以及我们的贡献者页面了解更多信息。
“琥珀色”一词指的是两件事。首先，它是一套分子力学力场用于模拟生物分子；这些力场属于公共领域，用于各种仿真程序。其次，它是一个包，共个分子模拟程序其中包括源代码和演示。
琥珀分为两部分：琥珀色工具24和琥珀色24。请参阅下载琥珀色链接获取有关如何下载代码的信息。
琥珀是在以下公司的积极合作下开发的戴维·凯斯在罗格斯大学，汤姆·切萨姆犹他大学，雷·罗加州大学欧文分校，肯·默兹密歇根州立大学，玛丽亚·纳根在石溪，丹·罗在NIH，阿德里安·罗特伯格在佛罗里达大学，卡洛斯·辛默林在石溪，王俊美匹兹堡大学，达林·约克在罗格斯大学，和许多其他人琥珀最初是在彼得的领导下开发的科尔曼。
Conflex创建了一个琥珀简介（日语）。
有关琥珀色代码的全面概述，请参阅：
R.Salomon-Ferrer，D.A.Case，R.C.Walker。琥珀色概述生物分子模拟软件包。电线计算。分子科学。 三，198-210 (2013). (PDF格式)
D.A.Case、T.E.Cheatham，III、T.Darden、H.Gohlke、R.Luo、K.M.Merz，Jr.、A。Onufriev、C.Simmerling、B.Wang和R.Woods。琥珀生物分子仿真程序。J.计算机。化学。 26,1668-1688 (2005).
D.A.Case、H.M.Aktulga、K.Belfon、D.S.Cerutti、G.A.Cisneros、V.W.D.Cruzeiro、N.Forouzesh、T.J.Giese、A.W.Götz、H.Gohlke、S.Izadi、K.Kasavajhala、M.C.Kaymak、E.King、T.Kurtzman、T.-S.Lee、P.Li、J.Liu、T.Luchko、R.Luo、M.Manathunga、M.R.Machado、H.M.M.Nguyen、K.A.O'Hearn、A.V.Onufriev、F.Pan、S.Pantano、R.Qi、A.Rahnamoun，A.Risheh、S.Schott-Verdugo、A.Shajan、J.Swails、J.Wang、H.Wei、X.Wu、Y.Wu，S.Zhang、S.Zhao、Q.Zhu、T.E.Cheatham III、D.R.Roe、A.Roitberg、C.Simmerling、D.M.York、M.C.Nagan*和K.M.Merz Jr.AmberTools。化学杂志。信息模型。 63,6183-6191 (2023).
请参阅力场页面有关的信息代码支持的强制字段。
琥珀社区成员应遵守琥珀行为准则。
