鹿西尼亚斯®分子流行病学分析POT试剂盒

鹿西尼亚斯®分子流行病学分析POT试剂盒（用于不动杆菌）

不动杆菌属菌是包括医疗环境在内，在自然环境中广泛存在的日和见感染菌。
同时，对抗菌药显示高度耐药性的酸杆菌属菌也包含监视的事，在寻求医疗关联感染对策上被认为重要。
名古屋大学的荒川老师以及藤田医科大学的铃木老师开发的PCR-based ORF Typing（POT法）中
使用多重PCR，扩增酸杆菌属菌所持有的多个特定基因区域，对通过琼脂糖凝胶电泳法分离出的带型进行数值化，从而简化菌种的鉴定和A.baumannii打开
可以识别菌株和国际流行克隆。

＊本试验法是由厚生劳动科学研究费补助金对新兴、复兴感染症的革新性医药品等开发推进事业（H24-新兴-一般-010）开发的。

特性

●菌种的简易鉴定（A.baumannii单击功能区上，A.pittii单击功能区上，A.nosocomialis单击功能区上，A.sp.close to 13TU）
●A.baumannii菌株识别
●A.baumannii国际流行克隆Ⅰ和Ⅱ
●与Multilocus Sequence Typing（MLST）法基本相同的识别能力

套件配置（30次）

	个别名称	容量	数量
试剂A	AptaTaq DNA Master（5已重命名Conc.）*	240μL、L	一根
试剂B	PCR补充剂	240μL、L	一根
试剂C	底漆α	120μL、L	一根
试剂D	底漆β	120μL、L	一根
试剂E	正控制	240μL、L	一根
试剂F	6个已重命名装载缓冲区（BPB・XC）	240μL、L	一根

＊AptaTaq DNA Master（5已重命名Conc.）是Roche诊断K.K.的产品。

操作步骤

①	分离的菌株纯培养
②	进行DNA提取，制备模板DNA
③	2种多路PCR
④	琼脂糖凝胶电泳
⑤	读取带模式
⑥	POT值的计算
⑦	各检体的POT值的比较分析

分析方法

电泳模式

50:50bp DNA梯度
PC：积极控制
1,2：A.baumannii（ST2）从同一事例得到的临床分离株
3：A.baumannii（ST2）
4：A.baumannii（ST2）耐多药性A.baumannii
5：A.baumannii（ST1）ATCC^®BAA1605
6：A.baumannii（ST1）
7：A.baumannii（ST152）
8：A.baumannii（ST34）
9：A.pittii
10：A.nosocomialis
11：A.sp.close toA.nosocomialis
根据名古屋大学的荒川宜亲老师和藤田医科大学铃木匡弘老师的厚意，提供了电泳图案的实例数据。

检测ORF的种类（目标区域）及其PCR扩增产物尺寸

	POT No。	放大尺寸（bp）	目标区域
读取，读取 mixture1	PCR PC	553	atpA
	A.baumannii	465	OXA-51
	A.pittii	401	特定gene
	A.nosocomialis	362	特定gene
	A。sp.close to 13TU	321	特定gene
	POT1-1	271	Genomic Islet-1
	POT1-2	231	Genomic Islet-2
	POT1-3	189	Genomic Islet-3
	POT1-4	151	Genomic Islet-4
	POT1-5	122	Genomic Islet-5
	POT1-6	102	Genomic Islet-6
	POT1-7	81	Genomic Islet-7
读取，读取 mixture2	PCR PC	565	OXA-51
	POT2-1	457	Genomic Island-1
	POT2-2	388	Genomic Island-2
	POT2-3	329	Genomic Island-3
	POT2-4	280	Genomic Island-4
	POT2-5	237	Genomic Island-5
	POT2-6	209	Genomic Island-6
	POT3-1	185	Genomic Island-7
	POT3-2	160	Genomic Island-8
	POT3-3	139	Genomic Island-9
	POT3-4	120	Genomic Island-10
	POT3-5	101	Genomic Island-11
	POT3-6	81	Genomic Island-12

①根据2个多路PCR的电泳结果读取带型。
②使用该电泳带的有无结果，在POT值解析用Excel表中用二进制输入，计算3个类别的POT值。
i）PCR PC为阳性时，可确认其检体为无酸杆菌属菌。
ii）POT值1小于1000时A.baumannii、1000以上且不足2000时A.pittii。要使
如果2000以上不到3000A.nosocomialis、3000以上且不到4000时A。sp.close to 13TU
如果是4000以上的话，虽然是不动杆菌属菌，但菌种被判定为不明。
通过比较检体间POT值A.baumannii的菌体间的同源性可以客观地推测。
iv）从集体感染得到的菌体，POT1～3的POT值全部相同。

分类	样本编号
分类	1个	2	3	4个	5	6个	7	8个	9	10	11
POT1	122	122	122	122	69	69	72	104	1105	2105	3105
POT2	59	59	26	53	46	42	0	8个	0	0	0
POT3	54	54	54	41	59	27	8个	0	0	0	0

产品列表

产品编号	产品名称	保存温度	标准	包装	价格
08062-96	鹿西尼亚斯分子流行病学分析POT试剂盒（用于不动杆菌） Cica geneus Acineto POT KIT	冷冻	分子生物学用	1次（30次）	¥44000
08178-96	鹿西尼亚斯DNA提取试剂 Cica geneus DNA extraction reagent	冷藏	分子生物学用	1次（120次）	¥24000

本配套元件从爱知县和名古屋大学得到专利许可，制造销售。
有关其他厂商商品的许可证专利，请向各厂商确认。
产品的规格，因为产品的改良有变更的情况。请事先谅解。

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