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鹿西尼亚斯® 分子流行病学分析POT试剂盒(用于不动杆菌)

不动杆菌属菌是包括医疗环境在内,在自然环境中广泛存在的日和见感染菌。
同时,对抗菌药显示高度耐药性的酸杆菌属菌也包含监视的事,在寻求医疗关联感染对策上被认为重要。
名古屋大学的荒川老师以及藤田医科大学的铃木老师开发的PCR-based ORF Typing(POT法)中
使用多重PCR,扩增酸杆菌属菌所持有的多个特定基因区域,对通过琼脂糖凝胶电泳法分离出的带型进行数值化,从而简化菌种的鉴定和A. baumannii打开
可以识别菌株和国际流行克隆。

*本试验法是由厚生劳动科学研究费补助金对新兴、复兴感染症的革新性医药品等开发推进事业(H24-新兴-一般-010)开发的。

特性

●菌种的简易鉴定(A. baumanniiA. pittiiA. nosocomialisA.sp.close to 13TU)
A. baumannii菌株识别
A. baumannii国际流行克隆Ⅰ和Ⅱ
●与Multilocus Sequence Typing(MLST)法基本相同的识别能力

套件配置(30次)

 个别名称容量数量
试剂A AptaTaq DNA Master(5×Conc.)* 240 μL 一根
试剂B PCR补充剂 240 μL 一根
试剂C 底漆α 120 μL 一根
试剂D 底漆β 120 μL 一根
试剂E 正控制 240 μL 一根
试剂F 6×装载缓冲区(BPB・XC) 240 μL 一根

*AptaTaq DNA Master(5×Conc.)是Roche诊断K.K.的产品。

操作步骤

分离的菌株纯培养
进行DNA提取,制备模板DNA
2种多路PCR
琼脂糖凝胶电泳
读取带模式
POT值的计算
各检体的POT值的比较分析

分析方法

s_eidouzou_acineto.png

电泳模式

50:50bp DNA梯度
PC:积极控制
1,2:A. baumannii(ST2)从同一事例得到的临床分离株
3:A. baumannii(ST2)
4:A. baumannii(ST2)耐多药性A. baumannii
5:A. baumannii(ST1)ATCC®BAA1605
6:A. baumannii(ST1)
7:A. baumannii(ST152)
8:A. baumannii(ST34)
9:A. pittii
10:A. nosocomialis
11:A. sp. close toA. nosocomialis
根据名古屋大学的荒川宜亲老师和藤田医科大学铃木匡弘老师的厚意,提供了电泳图案的实例数据。

检测ORF的种类(目标区域)及其PCR扩增产物尺寸

 POT No.放大尺寸(bp)目标区域

Reaction
mixture 1
PCR PC 553 atpA
A. baumannii 465 OXA-51
A. pittii 401 Specific gene
A. nosocomialis 362 Specific gene
A.sp. close to 13TU 321 Specific gene
POT 1-1 271 Genomic Islet-1
POT 1-2 231 Genomic Islet-2
POT 1-3 189 Genomic Islet-3
POT 1-4 151 Genomic Islet-4
POT 1-5 122 Genomic Islet-5
POT 1-6 102 Genomic Islet-6
POT 1-7 81 Genomic Islet-7
Reaction
mixture 2
PCR PC 565 OXA-51
POT 2-1 457 Genomic Island-1
POT 2-2 388 Genomic Island-2
POT 2-3 329 Genomic Island-3
POT 2-4 280 Genomic Island-4
POT 2-5 237 Genomic Island-5
POT 2-6 209 Genomic Island-6
POT 3-1 185 Genomic Island-7
POT 3-2 160 Genomic Island-8
POT 3-3 139 Genomic Island-9
POT 3-4 120 Genomic Island-10
POT 3-5 101 Genomic Island-11
POT 3-6 81 Genomic Island-12

①根据2个多路PCR的电泳结果读取带型。
②使用该电泳带的有无结果,在POT值解析用Excel表中用二进制输入,计算3个类别的POT值。
i)PCR PC为阳性时,可确认其检体为无酸杆菌属菌。
ii)POT值1小于1000时A. baumannii、1000以上且不足2000时A. pittii
如果2000以上不到3000A. nosocomialis、3000以上且不到4000时A.sp. close to 13TU、
如果是4000以上的话,虽然是不动杆菌属菌,但菌种被判定为不明。
通过比较检体间POT值A. baumannii的菌体间的同源性可以客观地推测。
iv)从集体感染得到的菌体,POT1~3的POT值全部相同。


分类
样本编号
1234567891011
POT 1 122 122 122 122 69 69 72 104 1105 2105 3105
POT 2 59 59 26 53 46 42 0 8 0 0 0
POT 3 54 54 54 41 59 27 8 0 0 0 0

产品列表

产品编号 产品名称 保存温度 标准 包装 价格
08062-96 鹿西尼亚斯R分子流行病学分析POT试剂盒(用于不动杆菌)
Cica geneusR Acineto POT KIT
冷冻 分子生物学用 1次(30次) ¥44,000
08178-96 鹿西尼亚斯R DNA提取试剂
Cica geneusR DNA extraction reagent
冷藏 分子生物学用 1次(120次) ¥24,000

本配套元件从爱知县和名古屋大学得到专利许可,制造销售。
有关其他厂商商品的许可证专利,请向各厂商确认。
产品的规格,因为产品的改良有变更的情况。请事先谅解。

・关于“法律”、“SDS”、“库存”等详细信息,请点击产品编号进行确认。
・购买和使用试剂时

小册子

鹿西尼亚斯®分子流行病学分析POT试剂盒(用于不动杆菌)

使用说明书

鹿西尼亚斯®分子流行病学分析POT试剂盒(用于不动杆菌)

计算表(ZIP文件、Excel)

POT值解析用Excel表(ZIP文件、730KB)

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