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鹿西尼亚斯®分子流行病学分析POT试剂盒(金黄色葡萄球菌用)

s_pot_staph_title.jpg

耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)是医疗相关感染的主要原因菌,为了防止这种蔓延,菌体
中描述的相应参数的值。
藤田医科大学的铃木匡弘老师开发的PCR-based ORF Typing(POT法)
用雷克斯PCR同时扩增多个特定基因,用琼脂糖电泳检测的扩增条带
这是分析德国模式,比较菌体间同源性的方法。

特性

●约4小时可以进行分子流行病学解析
●与脉冲场凝胶电泳(PFGE)不同,可通过通用设备进行测定
●通过将分析结果数值化(POT值),可以比较菌体间的同源性

套件配置

 个别名称容量数量
试剂A AptaTaq DNA Master(5×Conc.)* 1.0 mL 一根
试剂B PCR补充剂 1.0 mL 一根
试剂C 底漆α 0.5 mL 一根
试剂D 底漆β 0.5 mL 一根
试剂E 正控制 1.0 mL 一根
试剂F 6×装载缓冲区(BPB・XC) 1.0 mL 一根

*AptaTaq DNA Master(5×Conc.)是Roche诊断K.K.的产品。

操作步骤

分离(培养)金黄色葡萄球菌
进行DNA提取,制备模板DNA
2种多路PCR
琼脂糖凝胶电泳
读取带模式
POT值的计算
各检体的POT值的比较分析

分析方法

s_pot_staph_1.jpg
电泳模式

50:50bp DNA梯度
P:积极控制
1:ATCC®700699(MRSA Mu50)
2:ATCC®BAA-1556(MRSA USA300)
3:ATCC®43300(MRSA)
4:ATCC®25923(MSSA)
5:ATCC®29213(MSSA)
6,7:从集体感染事例1得到的临床分离株
8,9:从集体感染事例2得到的临床分离株

根据藤田医科大学铃木匡弘老师的厚意,提供了电泳图案的实例数据。

检测ORF的种类(目标区域)及其PCR扩增产物尺寸

 POT No.放大尺寸(bp)目标区域

Reaction
mixture 1
femA 601 S. aureuspositive control
POT 1-1 530 mecA
POT 1-2 449 mecgene complex class B
POT 1-3 355 SCCmectype Ⅱa specific
POT 2-1 304 Tn554
POT 2-2 271 原噬菌体
POT 2-3 228 原噬菌体
POT 2-4 197 原噬菌体
POT 2-5 161 原噬菌体
POT 2-6 131 原噬菌体
POT 2-7 106 原噬菌体
POT 2-8 81 Genomic Island
Reaction
mixture 2
femA 601 S. aureuspositive control
POT 1-4 477 cassette chromosome recombinase A2
POT 1-5 388 遗传背景
POT 1-6 320 遗传背景
POT 1-7 273 mecgene complex class A
POT 3-1 243 原噬菌体
POT 3-2 197 原噬菌体
POT 3-3 171 原噬菌体
POT 3-4 140 原噬菌体
POT 3-5 115 原噬菌体
POT 3-6 95 原噬菌体
POT 3-7 78 原噬菌体

①根据2个多路PCR的电泳结果读取带型。
②使用该电泳带的有无结果,在POT值解析用Excel表中用二进制输入,计算3个类别的POT值。
ⅰ)femA如果是阳性的话,可以确认那个检体是金黄色葡萄球菌。
另外,MRSA时,POT1的值合计为64以上。
ii)通过比较检体间的POT值,可以客观地推测菌体间的同源性。
从集体感染中获得的菌体,POT1~3的POT值全部相同。


分类
样本编号
123456789
POT 1 93 106 95 6 4 93 93 73 73
POT 2 255 77 136 16 58 190 190 156 156
POT 3 96 113 66 35 112 103 103 120 120


产品列表

产品编号 产品名称 保存温度 标准 包装 价格
08178-96 鹿西尼亚斯R DNA提取试剂
Cica geneusR DNA extraction reagent
冷藏 分子生物学用 1次(120次) ¥24,000
08180-96 鹿西尼亚斯R分子流行病学分析POT试剂盒(金黄色葡萄球菌用)
Cica geneusR staph POT kit
冷冻 分子生物学用 1次(120次) ¥87,000
08180-97 鹿西尼亚斯R分子流行病学分析POT试剂盒(金黄色葡萄球菌用)
Cica geneusR staph POT kit
冷冻 分子生物学用 1次(30次) ¥40,000

・关于“法律”、“SDS”、“库存”等详细信息,请点击产品编号进行确认。
・购买和使用试剂时

小册子

鹿西尼亚斯®分子流行病学分析试剂盒(金黄色葡萄球菌用)

使用说明书

鹿西尼亚斯®分子流行病学分析POT试剂盒(金黄色葡萄球菌用)120次用

鹿西尼亚斯®分子流行病学分析POT试剂盒(金黄色葡萄球菌用)30次用

计算表(ZIP文件、Excel)

POT(Staph)计算表(ZIP文件,730KB)

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