鹿西尼亚斯®分子流行病学分析POT试剂盒(金黄色葡萄球菌用)
耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)是医疗相关感染的主要原因菌,为了防止这种蔓延,菌体
中描述的相应参数的值。
藤田医科大学的铃木匡弘老师开发的PCR-based ORF Typing(POT法)
用雷克斯PCR同时扩增多个特定基因,用琼脂糖电泳检测的扩增条带
这是分析德国模式,比较菌体间同源性的方法。
特性
●约4小时可以进行分子流行病学解析
●与脉冲场凝胶电泳(PFGE)不同,可通过通用设备进行测定
●通过将分析结果数值化(POT值),可以比较菌体间的同源性
套件配置
| 个别名称 | 容量 | 数量 |
试剂A |
AptaTaq DNA Master(5×Conc.)* |
1.0 mL |
一根 |
试剂B |
PCR补充剂 |
1.0 mL |
一根 |
试剂C |
底漆α |
0.5 mL |
一根 |
试剂D |
底漆β |
0.5 mL |
一根 |
试剂E |
正控制 |
1.0 mL |
一根 |
试剂F |
6×装载缓冲区(BPB・XC) |
1.0 mL |
一根 |
*AptaTaq DNA Master(5×Conc.)是Roche诊断K.K.的产品。
操作步骤
① |
分离(培养)金黄色葡萄球菌 |
② |
进行DNA提取,制备模板DNA |
③ |
2种多路PCR |
④ |
琼脂糖凝胶电泳 |
⑤ |
读取带模式 |
⑥ |
POT值的计算 |
⑦ |
各检体的POT值的比较分析 |
分析方法
电泳模式
50:50bp DNA梯度
P:积极控制
1:ATCC®700699(MRSA Mu50)
2:ATCC®BAA-1556(MRSA USA300)
3:ATCC®43300(MRSA)
4:ATCC®25923(MSSA)
5:ATCC®29213(MSSA)
6,7:从集体感染事例1得到的临床分离株
8,9:从集体感染事例2得到的临床分离株
根据藤田医科大学铃木匡弘老师的厚意,提供了电泳图案的实例数据。
检测ORF的种类(目标区域)及其PCR扩增产物尺寸
| POT No. | 放大尺寸(bp) | 目标区域 |
Reaction mixture 1 |
femA |
601 |
S. aureuspositive control |
POT 1-1 |
530 |
mecA |
POT 1-2 |
449 |
mecgene complex class B |
POT 1-3 |
355 |
SCCmectype Ⅱa specific |
POT 2-1 |
304 |
Tn554 |
POT 2-2 |
271 |
原噬菌体 |
POT 2-3 |
228 |
原噬菌体 |
POT 2-4 |
197 |
原噬菌体 |
POT 2-5 |
161 |
原噬菌体 |
POT 2-6 |
131 |
原噬菌体 |
POT 2-7 |
106 |
原噬菌体 |
POT 2-8 |
81 |
Genomic Island |
Reaction mixture 2 |
femA |
601 |
S. aureuspositive control |
POT 1-4 |
477 |
cassette chromosome recombinase A2 |
POT 1-5 |
388 |
遗传背景 |
POT 1-6 |
320 |
遗传背景 |
POT 1-7 |
273 |
mecgene complex class A |
POT 3-1 |
243 |
原噬菌体 |
POT 3-2 |
197 |
原噬菌体 |
POT 3-3 |
171 |
原噬菌体 |
POT 3-4 |
140 |
原噬菌体 |
POT 3-5 |
115 |
原噬菌体 |
POT 3-6 |
95 |
原噬菌体 |
POT 3-7 |
78 |
原噬菌体 |
①根据2个多路PCR的电泳结果读取带型。
②使用该电泳带的有无结果,在POT值解析用Excel表中用二进制输入,计算3个类别的POT值。
ⅰ)femA如果是阳性的话,可以确认那个检体是金黄色葡萄球菌。
另外,MRSA时,POT1的值合计为64以上。
ii)通过比较检体间的POT值,可以客观地推测菌体间的同源性。
从集体感染中获得的菌体,POT1~3的POT值全部相同。
分类 | 样本编号 |
1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 |
POT 1 |
93 |
106 |
95 |
6 |
4 |
93 |
93 |
73 |
73 |
POT 2 |
255 |
77 |
136 |
16 |
58 |
190 |
190 |
156 |
156 |
POT 3 |
96 |
113 |
66 |
35 |
112 |
103 |
103 |
120 |
120 |
产品列表
产品编号 |
产品名称 |
保存温度 |
标准 |
包装 |
价格 |
08178-96 |
鹿西尼亚斯R DNA提取试剂 Cica geneusR DNA extraction reagent |
冷藏 |
分子生物学用 |
1次(120次) |
¥24,000 |
08180-96 |
鹿西尼亚斯R分子流行病学分析POT试剂盒(金黄色葡萄球菌用) Cica geneusR staph POT kit |
冷冻 |
分子生物学用 |
1次(120次) |
¥87,000 |
08180-97 |
鹿西尼亚斯R分子流行病学分析POT试剂盒(金黄色葡萄球菌用) Cica geneusR staph POT kit |
冷冻 |
分子生物学用 |
1次(30次) |
¥40,000 |
・关于“法律”、“SDS”、“库存”等详细信息,请点击产品编号进行确认。
・购买和使用试剂时
小册子
鹿西尼亚斯®分子流行病学分析试剂盒(金黄色葡萄球菌用)
使用说明书
鹿西尼亚斯®分子流行病学分析POT试剂盒(金黄色葡萄球菌用)120次用
鹿西尼亚斯®分子流行病学分析POT试剂盒(金黄色葡萄球菌用)30次用
计算表(ZIP文件、Excel)
POT(Staph)计算表(ZIP文件,730KB)
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